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古生物学家发现，许多已经灭绝的爬行动物头顶都有眼睛，它是这些动物视觉器官的重要补充。现今挖掘出的许多古代爬行动物的化石，其顶部也都有眼眶的痕迹，人们认为头顶视力使得爬行动物可以对其身体进行调整。
这一器官对光波和磁场都非常敏感，还一些科学家认为，第三只眼睛还能感觉超声波和次声波。正是因为具有这一独特的器官，爬行动物才对类似地震、磁暴和火山爆发等自然灾变非常敏感。
而不少的科学家在研究松果体的过程中都会不由自主的转换到神学上面。
根据俄罗斯科学家康斯坦丁·齐奥尔科夫斯基创立的宇宙理论，人体是一个双星系统，大脑将宇宙中的能量汇集起来，而身体与地面振荡保持一致。
所以松果体能够从宇宙中获得超凡的想象力，并将其化为神经冲动，到达丘脑下部。那里是神经系统、内分泌系统和颈神经节交会的地方，神经纤维众多。
然后这些信号随着视神经进入视网膜，视网膜上便出现虚拟的图像，同时图像以神经冲动的形式继续传人大脑的视觉皮层，产生意识。
同时，他认为古代的那些祭司充分利用了这一退化器官，为了发挥第三只眼睛的功能，他们将目光转向宝石。
他们用钻石做头饰，在宗教仪式时佩戴，或许宇宙的神秘能量正是通过宝石晶莹剔透的结构，以光束的形式会聚到头顶，从而使电磁波到达松果体并作用于其组织。
同时，参与研究的科学家还发现了一种很有意思也很诡异的现象，那就是，将一生献给宗教或喜好沉思的人，他们体内会发生令人难以置信的生物化学变化，即头顶的骨骼会变薄。
早在19世纪末，俄罗斯著名科学家弗拉基米尔·卡拉瓦耶夫就对这一现象做了详细的研究。他认为某些思维活动能使人体的整个分子结构发生强烈振荡。
除此之外，古代曾经有能量中枢之说，该中枢负责人体机能的正常发挥。这一中枢很早就被称为第三只眼睛，因为它能接收和反映出具体的图像。
同时，位于神学之后，松果体，也就是人类的第三只眼睛在生物学上也位于很大的作用。
俄罗斯专家发现，松果体在不同时期都发挥着积极作用，其组成细胞类似视网膜的色素细胞，能够分泌血清素和褪黑激素。
褪黑激素在夜晚分泌，具有镇静作用；而血清素通常在白天分泌，作用与前者正好相反，能够激发肌体活性。二者的分泌量也是相当恒定的。
研究还发现，松果体能够防止衰老，因为它所分泌的褪黑激素能够部分遏制年轻人的xing\功能，从而平衡中年和青年时期的xing\生活频率，延长生育期，提高寿命。
在对松果体深入研究的基础上，他们研制出了一种抗衰老新药，他们在猴子身上试验了这一药物，几只老母猴服药后，身体发生了神奇的变化，逐渐年轻，其分泌的褪黑激素增加。
在连续注射数天后，动物体内其他激素的分泌也都调整过来，自我感觉良好，生命力更为旺盛，身体开始换毛，因为松果体所产生的褪黑激素是细胞间物质交换的信号分子。
可以说，无论在神学上面还是生物上面，这个第三只眼睛-松果体都扮演着十分重要的角色。